Sarah Cristina de Oliveira da Paixão
No dia 06 de maio de 2021, por meio de vídeo chamada pelo aplicativo do googlemeet.com (em decorrência da pandemia causada pela COVID-19), a aluna de pós-graduação em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente do Instituto de Botânica de São Paulo (IBt), Sarah Cristina Oliveira da Paixão, (bolsista FAPESP/CAPES) defendeu sua tese de doutorado intitulada “Estudo morfológico e molecular de espécies do filo Oomycota isoladas de cultivo de truta arco-íris (Oncorhynchus mykiss Walbaum) em Campos do Jordão, estado de São Paulo, Brasil”.
A banca examinadora foi composta pela sua orientadora Dra. Carmen Lidia Amorim Pires-Zottarelli (Instituto de Botânica), Dra. Cristiane de Almeida Nascimento (Universidade Federal do Piauí), Dr.Eduardo Pareira Cabral Gomes (Instituto de Botânica), Dra. Claudia Maris Ferreira Mostério (Instituto de Pesca) e Dra. Iracema Helena Schoenlein Crusius (Instituto de Botânica).
Estudo morfológico e molecular de espécies do filo Oomycota isoladas de cultivo de truta arco-íris (Oncorhynchus mykiss Walbaum) em Campos do Jordão, estado de São Paulo, Brasil
ABSTRACT
The intensive cultivation of fish in confined spaces interferes with the ecology of the environment due to trophic interactions and increased organic matter, which can favor the emergence of diseases caused by oomycetes, which are efficient in dispersion in aquatic environments. Saprolegniosis, a disease caused by species of the genus Saprolegnia, is the best known of diseases caused by oomycetes, with frequent records in salmonids, in the different stages of fish development. In Brazil, rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum) was introduced in the 1940s, and today it is a successful example of fish farming in cold and mountainous regions of the country. However, there is no knowledge about the occurrence of oomycetes in these farming systems in the country, which can affect the quality of the fish and interfere with the production. In view of this, the present study had as main objective to evaluate the richness and the diversity of the representatives of the phylum Oomycota, in two trout farm of Campos do Jordão, in the period of one year (August/November 2016 and March/June 2017). For this, water samples that supply the cultivation systems were collected; of the breeding tanks, in the different stages of development of the trout, as well as of the water of entrance and exit of the systems. Eggs and dead fish were collected, when present. In laboratory, water samples were treated by the multiple baiting technique, in order to obtain the largest number of specimens. Mycelium of oomycetes apparent in the eggs, as well as obtained by scraping the epidermis of dead fish was inoculated in specific culture media. Through morphological and molecular studies (ITS, LSU and/or SSU regions of the rDNA), 535 specimens of oomycetes were recorded, from 276 water samples analysed, as well as dead fish and colonized eggs, which belong to the orders Olpidiopsidales s.l., Peronosporales s.l. and Saprolegniales. The order Saprolegniales was the best represented in the study, with genus Achlya being the most abundant. The distribution of oomycetes in the studied systems allows us to assume that water is the main means of dispersion of these organisms, which were present in greater abundance in colder periods of the sampling, however, without significant difference in relation to the warmer seasons (p < 0,05). The community structure calculated showed to be diverse the mycota, with 86% similarity between both truticultures. From the specimens obtained in both truticultures, 33 taxa were identified, 23 at specific level, all mentioned for the first time for Campos do Jordão. Newbya oblongata, Pythiogeton abundans and Phytopythium litorale are first citations for Brazil, and Aphanomyces brasiliensis a new species for science. Oomycetes were registered for the first time in trout farms in the country, expanding the knowledge of these organisms in fish farms in Brazil, with analysis throughout the trout farm system, making it possible to understand the dynamics of these organisms in the system and the identification of potential pathogens.
Keywords: Diversity, oomycetes, trout farm studies
RESUMO
O cultivo intensivo de peixes em espaço confinado interfere na ecologia do ambiente devido às interações tróficas e aumento da matéria orgânica, o que pode favorecer o surgimento de doenças causadas por oomicetos, os quais apresentam eficiência na dispersão em ambientes aquáticos. A saprolegniose, doença causada por espécies do gênero Saprolegnia, é a mais conhecida das parasitoses causada por omicetos, com registros frequentes em salmonídeos, nas diferentes fases de desenvolvimento do peixe. No Brasil, a truta arco-íris (Oncorhynchus mykiss Walbaum) foi introduzida na década de 40, sendo hoje um exemplo de sucesso na criação de peixes em regiões frias e montanhosas do país. No entanto, não há conhecimento sobre a ocorrência de oomicetos nestes sistemas de cultivo no país, os quais podem afetar a qualidade do pescado e interferir na produção. Em vista disto, o presente estudo teve como objetivo principal avaliar a riqueza e a diversidade dos representantes do filo Oomycota, em duas truticulturas de Campos do Jordão, no período de um ano (agosto/novembro de 2016 e março/junho de 2017). Para isto, foram coletadas amostras da água que abastecem os sistemas de cultivo; dos tanques de criação, nas diferentes fases de desenvolvimento da truta, bem como da água de entrada e saída dos sistemas. Ovos e peixes mortos foram coletados, quando existentes. Em laboratório, amostras de água foram tratadas pelo método de iscagem múltipla, a fim de se obter o maior número de espécimes. Micélio de oomicetos aparente nos ovos, bem como obtido pela raspagem da epiderme de peixes mortos coletados, foi inoculado em meios de cultura específicos. Por meio de estudos morfológicos e moleculares (regiões ITS, LSU e/ou SSU do rDNA), foram registrados 535 espécimes de oomicetos, de 276 amostras de água analisadas, bem como dos peixes mortos e ovos colonizados, os quais são pertencentes x às ordens Olpidiopsidales s.l., Peronosporales s.l. e Saprolegniales. A ordem Saprolegniales foi a melhor representada no estudo, com o gênero Achlya sendo o mais abundante. A distribuição dos oomicetos nos sistemas estudados permite supor que a água é o principal meio de dispersão destes organismos, os quais estiveram presentes em maior abundância em épocas mais frias do período de coleta, no entanto, sem diferença significativa com relação às épocas mais quentes (p < 0,05). O cálculo da estrutura da comunidade mostrou ser a micota de oomicetos diversa, com 86% de similaridade entre ambas truticulturas. Dos espécimes obtidos nas duas truticulturas, 33 táxons foram identificados, com 23 em nível específico, todos mencionados pela primeira vez em Campos do Jordão. Newbya oblongata, Pythiogeton abundans e Phytopythium litorale são primeiras citações para o Brasil, e Aphanomyces brasiliensis uma espécie nova para a ciência. Pela primeira vez foram registrados oomicetos em truticuluras no país, ampliando o conhecimento destes organismos em pisciculturas no Brasil, com análise em todo o sistema de cultivo da truta, possibilitando compreender a dinâmica destes organismos no sistema e a identificação de potenciais patógenos.
Palavras-chave: Diversidade, oomicetos, truticultura
Sarah Cristina de Oliveira da Paixão
Estudo morfológico e molecular de espécies do filo Oomycota isoladas de cultivo de truta arco-íris (Oncorhynchus mykiss Walbaum) em Campos do Jordão, estado de São Paulo, Brasil
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