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Danilo Reis Gonçalves


Em 29 de março de 2016, no anfiteatro do Instituto de Botânica (IBt), o aluno de Mestrado do Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente Danilo Reis Gonçalves (Bolsista FAPESP), defendeu a sua dissertação intitulada “Levantamento de espécies de Pythium sensu lato de sistemas hidropônicos da região metropolitana de São Paulo”. A banca examinadora foi composta pela Dra. Carmen Lidia Amorim Pires-Zottarelli (orientadora/IBt), Dra. Flávia Rodrigues Alves Patrício (IB-SP) e Dr. Matheus Aparecido Pereira Cipriano (UNIFESP).


Levantamento de espécies de Pythium sensu lato de sistemas hidropônicos da região metropolitana de São Paulo


ABSTRACT

Pythium sensu lato is considered of great importance due the potential of many species as plant pathogens in hydroponics crops. Considering the economic importance of hydroponics production for São Paulo metropolitan region, studies that contributes to the development of this sector become essential nowadays. From March/2014 to March/2015, different samples (water from artesian/semi-artesian well, nutrient solution, substrate and crops roots) were collected in hydroponic systems localized at the São Paulo metropolitan region and cities nearby. At the laboratory, the samples in triplicate of substrate (5 g), water from artesian and semi-artesian well and nutrient solution (30 mL) were baited with Sorghum sp. seeds and onion skins (Allium cepa). In the case of the crops collected, five roots fragments were cut and placed in CMA (cornmeal ágar) culture medium with the antibiotics nystatin, ampicillin, rifampicin and miconazole. After 3-4 days of incubation, the specimens obtained were purified and identified through the morphology and sequencing of the ITS rDNA and COI mDNA regions. It was possible to isolate specimens of Pythium sensu lato from all type of samples collected, being the majority of the isolates from roots of hydroponic crops and nutrient solution. Six species of Pythium (P. kashmirense, P. middletonii, P. oopapillum, P. periplocum, P. segnitium and Pythium sp.1) and two species of Phytopythium (Py. helicoides e Py. vexans), besides the isolates of Pythium from Group F and others oomycetes (Achlya hypogyna, Saprolegnia ferax and S. semihypogyna) were obtained. The in vitro pathogenicity of some species were tested showing that P. periplocum and Py. helicoides can cause death of hydroponics crops seedlings. From all farms visited, the most produced crops are Lactuca sativa, Eruca sativa and Lepidium sativum. Also, 96% of the growers reported that losses in the production caused by Pythium s. l. have occurred, mainly during the warm seasons. It was concluded that avoiding the entrance of Pythium spp. in the systems is essential to prevent future outbreaks in the production, being the producers responsible to use substrates and water of good quality.
Keywords: hydroponics, Oomycota, taxonomy

RESUMO

Pythium sensu lato é considerado de grande importância devido ao potencial parasítico de muitas de suas espécies em cultivos hidropônicos. Devido a importância econômica da hidroponia para a região metropolitana de São Paulo, estudos que contribuam para o desenvolvimento deste setor são fundamentais. Em vista disto, de março/2014 a março/2015, foram realizadas coletas de diferentes amostras (água de poço artesiano/semi-artesiano, solução nutritiva, substrato e raízes de hortaliças) em sistemas hidropônicos localizados na região metropolitana de São Paulo e cidades vizinhas. No laboratório, as amostras, em triplicata, de substrato (5g), água de poço artesiano/semi-artesiano e solução nutritiva (30 mL) foram iscadas com sementes de Sorghum sp. e epiderme de Allium cepa (cebola). No caso das hortaliças, cinco fragmentos de raízes foram cortados e depositados em meio de cultura CMA (“cornmeal” ágar) acrescido dos antibióticos nistatina, ampicilina, rifampicina e miconazol. Após a incubação por 3-4 dias, os espécimes obtidos foram purificados e identificados morfologicamente e molecularmente por meio do sequenciamento das regiões ITS do rDNA e COI do mDNA. Foi possível isolar espécimes de Pythium sensu lato de todos os tipos de amostras coletadas, sendo a maioria destes provenientes de amostras de raízes de hortaliças e solução nutritiva. Seis espécies de Pythium (P. kashmirense, P. middletonii, P. oopapillum, P. periplocum, P. segnitium e Pythium sp.1) e duas espécies de Phytopythium (Py. helicoides e Py. vexans), foram identificadas, além de isolados de Pythium pertencentes ao Grupo F, bem como outros oomicetos (Achlya hypogyna, Saprolegnia ferax e S. semihypogyna). A patogenicidade in vitro de cinco espécies foi testada demonstrando que P. periplocum e Py. helicoides, isolados de substratos, podem causar morte de plântulas de hortaliças hidropônicas. De todas as propriedades visitadas foi constatado que as culturas mais produzidas são a alface (Lactuca sativa), rúcula (Eruca sativa) e agrião (Lepidium sativum). Além disso, 96% dos produtores visitados relataram que já tiveram perdas na produção causadas por Pythium s. l., principalmente nas épocas mais quentes do ano. Pode-se concluir que a prevenção da entrada de Pythium spp. nos sistemas hidropônicos é fundamental para evitar futuros surtos de podridão de raiz, devendo o produtor se atentar à qualidade do substrato utilizado na produção das mudas e à água utilizada para abastecimento dos sistemas.
Palavras-chave: hidroponia, Oomycota, taxonomia


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Levantamento de espécies de Pythium sensu lato de sistemas hidropônicos da região metropolitana de São Paulo


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