Ana Lúcia de Jesus
Em 18 de fevereiro de 2020, no anfiteatro do Instituto de Botânica de São Paulo (IBt), a aluna da Pós-Graduação em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente do Instituto de Botânica de São Paulo (IBt), Ana Lucia de Jesus (Bolsista FAPESP), defendeu a sua tese de Doutorado intitulada “Diversidade e filogenia de Blastocladiomycota, Chytridiomycota e Monoblepharidomycota do Mosaico de Unidades de Conservação Juréia-Itatins, estado de São Paulo, Brasil”. A banca examinadora foi composta pela Dra. Carmen Lidia Amorim Pires-Zottarelli (orientadora/IBt), Dra. Rosely Ana Piccolo Grandi (IBt), Dra. Nair Sumie Yokoya (IBt), Dr. Denilson Fernandes Peralta (IBt) e Dr. Domingos da Silva Leite (UNICAMP).
Dr. Denilson Fernandes Peralta (IBt), Dra. Nair Sumie Yokoya, Dra. Rosely Ana Piccolo Grandi (IBt), Dra. Carmen Lidia Amorim Pires-Zottarelli (orientadora/IBt), a aluna Ana Lucia de Jesus e o Dr. Domingos da Silva Leite (UNICAMP)
Diversidade e filogenia de Blastocladiomycota, Chytridiomycota e Monoblepharidomycota do Mosaico de Unidades de Conservação Juréia-Itatins, estado de São Paulo, Brasil
ABSTRACT
Blastocladiomycota, Chytridiomycota, Monoblepharidomycota, Neocallimastigomycota, Olpidiomycota and Rozellomycota are phyla belonging to kingdom Fungi, which can be found as saprobes and /or parasites in aquatic and terrestrial ecosystems. Many species are especially decomposers of the cellulosic, chitinous and keratinous substrates, as well as sporopollenin, and some of them are important parasites of algae, plants and animals. These fungi have in common a posterior whiplash flagellum in the spore (zoospore), requiring water to complete its life cycle, and often survive for long period of time under adverse conditions through the production of resistance structures. In Brazil, studies with these phyla are still few, considering the size of the country and the limited number of specialists. Of approximately 1.200 described species, only 134 were registered in this country. When we consider the gene sequences of the species, the global picture is still worrying, because there are few researchers working with these groups and consequently a few numbers of sequences are available in GenBank. Therefore, this study had as its main objective, evaluate the richness and the diversity of zoosporic fungi belonging to Blastocladiomycota, Chytridiomycota and Monoblepharidomycota phyla, from aquatic and terrestrial ecosystems at “Mosaico de Unidades de Conservação Juréia-Itatins”. For this, four sampling were performed from August/2016 to October/2017, where were collected soil samples, and water, submerged leaves and surface sediment samples from freshwater bodies, in different locations. The samples were plated in the laboratory, baited with the multiple baiting technique and incubated for 7–30 days, which were analyzed with the optical microscopy. From 185 samples (45 water samples, 45 surface sediment samples, 45 submerged leaves samples, 45 soil samples and 5 submerged fruits – apple), 47 taxa were identified, being 19 species isolated in pure culture medium and/or in pure baits, allowing the sequencing of the ITS, LSU and SSU of the nuc rDNA and the construction of the phylogenetic trees. The morphological and phylogenetical analyses revealed a new genus, three new species for science and five new records for Brazil. In addition, was performed the zoospore ultrastructure technique in the three identified species, which assisted in the establishment of new taxa and/or new taxonomical classification within Chytridiomycota. In general, this study contributes not only to the expansion of the knowledge of the diversity of Brazilian zoosporic fungi, but also to the worldwide diversity, since the morphological, molecular and/or ultrastructural analyzes of these organisms showed new taxa for science. In addition, it allows the enrichment of gene databases by providing gene sequences from Brazilian isolates.
Key words: morphological and molecular diversity, zoosporic fungi, systematic, zoospore ultrastructure
RESUMO
Blastocladiomycota, Chytridiomycota, Monoblepharidomycota, Neocallimastigomycota, Olpidiomycota e Rozellomycota são filos pertencentes ao Reino Fungi, cujos representantes atuam como sapróbios e/ou parasitas nos ecossistemas aquáticos e terrestres. Embora muitas espécies sejam decompositoras especialmente de substratos celulósicos, queratinosos, quitinosos e esporopolenina, algumas se destacam como importantes parasitas de algas, plantas e animais. Estes fungos possuem em comum um flagelo liso, posteriormente inserido no esporo (zoósporo), necessitando de água para completar o seu ciclo de vida, podendo muitas vezes sobreviver por longo período de tempo em condições adversas por meio de estruturas de resistência. No Brasil, estudos com estes filos são ainda poucos, se considerarmos a dimensão do país e o restrito número de especialistas. De aproximadamente 1.200 espécies descritas, somente 134 foram até agora registradas no país. Quando consideramos as sequências gênicas das espécies, o quadro mundial é ainda mais preocupante, pois com escassos pesquisadores trabalhando com estes grupos, pouco até agora está disponível em bancos de dados gênicos. Diante disso, este estudo teve como objetivo principal avaliar a riqueza e a diversidade dos fungos zoospóricos pertencentes aos filos Blastocladiomycota, Chytridiomycota e Monoblepharidomycota, nos ecossistemas aquáticos e terrestres do Mosaico de Unidades de Conservação Juréia-Itatins. Para isto, quatro coletas foram realizadas de agosto/2016 a outubro/2017, onde foram coletadas quantidades padronizadas de solo, e de água, folhas submersas e sedimento do fundo de corpos d’ água, de diferentes locais. As amostras foram plaqueadas em laboratório, iscadas pela técnica de iscagem múltipla e incubadas de 7 a 30 dias, onde foram analisadas com auxílio de microscopia ótica. De 185 amostras (45 amostras de água, 45 de sedimento de fundo, 45 de folhas submersas, 45 de solo e 5 de frutos submersos – maçã), 47 espécies foram identificadas (02 Blastocladiomycota, 02 Monoblepharidomycota e 43 Chytridiomycota), com 19 delas isoladas em meio de cultura pura e/ou em iscas puras, permitindo o sequenciamento das regiões ITS, LSU e/ou SSU do nuc rDNA, as quais foram utilizadas para a construção de árvores filogenéticas. As análises morfológicas e filogenéticas revelaram um gênero novo, três novas espécies, bem como cinco novas citações para o país. Além disso, foi realizada a técnica de ultraestrutura de zoósporos, em três das espécies identificadas, a qual auxiliou no estabelecimento de novos táxons e/ou novas classificações taxonômicas dentro de Chytridiomycota. De maneira geral, este estudo contribuiu não só para a ampliação do conhecimento da diversidade de fungos zoospóricos brasileira, como também para a diversidade mundial, desde que as análises morfológicas, moleculares e/ou ultraestruturais destes organismos evidenciaram novos táxons para a ciência. Ao lado disso, permitiu o enriquecimento de bancos de dados gênicos, a partir da disponibilização de sequências gênicas de isolados brasileiros.
Palavras-chave: diversidade morfológica e molecular, fungos zoospóricos, sistemática, ultraestrutura dos zoósporos.
Ana Lúcia de Jesus
Diversidade e filogenia de Blastocladiomycota, Chytridiomycota e Monoblepharidomycota do Mosaico de Unidades de Conservação Juréia-Itatins, estado de São Paulo, Brasil
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