Sarah Cristina Oliveira Rocha
Em 14 de março de 2016, no anfiteatro do Instituto de Botânica (IBt), a aluna da pós-graduação em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente do Instituto de Botânica de São Paulo (IBt), Sarah Cristina Oliveira Rocha (bolsista FAPESP) defendeu sua dissertação de mestrado intitulada “Caracterização morfológica e molecular de espécies de Leptolegniaceae e Saprolegniaceae de áreas de Mata Atlântica do estado de São Paulo”.
A banca examinadora foi composta pela sua orientadora Dra. Carmen Lidia Amorim Pires-Zottarelli (orientadora/Instituto de Botânica), Dra. Christiane Ceriani Apparecido (Instituto Biológico) e Dra. Iracema Helena Schoenlein Crusius (Instituto de Botânica).
Caracterização morfológica e molecular de espécies de Leptolegniaceae e Saprolegniaceae de áreas de Mata Atlântica do estado de São Paulo
ABSTRACT
Saprolegniaceae sensu lato (Order Saprolegniales, Kingdom Straminipila) was divided in 1999 by M.W. Dick and collaborators in two families, Saprolegniaceae and Leptolegniaceae considering the morphological and molecular data (SSU rDNA region) of some representatives. These two families consist of saprotrophic and parasitic species typically found in terrestrial and aquatic ecosystems performing important ecological roles. However, both families are scarcely studied being necessary more studies in order to understand the phylogenetic relationships between its genera. Considering this, the aim of this study was to characterize through the morphological and molecular data the specimens of Leptolegniaceae and Saprolegniaceae, in order to contribute to the knowledge of the group. For this, 45 specimens were selected, being the majority collected at the Atlantic Forest of São Paulo State, representing 31 species belonging to the genus Achlya, Aphanomyces, Aplanopsis, Brevilegnia, Dictyuchus, Leptolegnia, Phragmosporangium, Plectospira, Pythiopsis and Saprolegnia. All specimens were characterized according to the morphology and/or molecular data (LSU and ITS rDNA regions) in order to confirm previous morphological identification and documented by photographs. From the species studied, the identity of 26 were confirmed, with the sequences obtained deposited in GenBank and used for phylogenetic analysis. The results corroborate a recent study by G.W. Beakes and collaborators in 2014, which rejects Leptolegniaceae and accepted it into the order Saprolegniales together with Saprolegniaceae, Verrucalvaceae and Achlyaceae (proposed by the authors). From the species studied, eight were sequenced for the first time in this study (Achlya orion Coker & Couch, A. oviparvula A.L. Rogers & Beneke, Brevilegnia longicaulis T.W. Johnson, Dictyuchus pseudodictyon Coker & Braxton, Leptolegnia eccentrica Coker, Phragmosporangium uniseriatum R.L. Seym., Pythiopsis irregularis R.L. Seym. and Saprolegnia truncata R.L. Seym.). The phylogenetic analyses have shown that the genus Leptolegnia belongs to Saprolegniaceae, however this is not a monophyletic genus, considering the separation of L. eccentrica from the other representatives. It was observed that the genus Phragmosporangium belongs to Verrucalvaceae, and not to Saprolegniaceae, as proposed in the original description of the genus/species. For the first time Brazilian specimens are included into phylogenetic analysis, which contributed to the discovery of a new species of Saprolegnia. This study makes a significant contribution to the taxonomy of Saprolegniales and demonstrates the importance of the morphological and molecular studies.
Keywords: Saprolegniales, ITS and LSU rDNA, Oomycota, Taxonomy
RESUMO
Saprolegniaceae sensu lato (Ordem Saprolegniales, Reino Straminipila) foi dividida em 1999 por M.W. Dick e colaboradores em duas famílias, Saprolegniaceae e Leptolegniaceae, considerando dados morfológicos e moleculares (região SSU do rDNA) de alguns de seus representantes. Estas famílias são compostas por espécies sapróbias e parasitas, normalmente presentes nos ecossistemas terrestres e aquáticos, onde desempenham importantes funções ecológicas. No entanto, são famílias pouco estudadas e que necessitam de um conhecimento mais aprofundado, visando o entendimento das relações filogenéticas entre os gêneros. Em vista disto, o principal objetivo deste estudo foi a caracterização morfológica e molecular de espécimes de Leptolegniaceae e Saprolegniaceae, com o intuito de contribuir para o conhecimento do grupo. Para isto, foram selecionados 45 espécimes, com a maioria proveniente de áreas de Mata Atlântica do Estado de São Paulo, os quais representaram 31 espécies pertencentes aos gêneros Achlya, Aphanomyces, Aplanopsis, Brevilegnia, Dictyuchus, Leptolegnia, Phragmosporangium, Plectospira, Pythiopsis e Saprolegnia. Todos os espécimes foram caracterizados em termos morfológicos e/ou moleculares (regiões LSU e ITS do rDNA) visando confirmação de identificação morfológica prévia, bem como documentados por meio de fotografias. Das espécies estudadas, 26 tiveram a identificação confirmada, com as sequências obtidas disponibilizadas no GenBank e utilizadas para análises filogenéticas. Os resultados obtidos corroboraram recente estudo realizado por G.W. Beakes e colaboradores em 2014, o qual rejeita Leptolegniaceae e aceita dentro da ordem Saprolegniales as famílias Saprolegniaceae, Verrucalvaceae e Achlyaceae, sendo esta última proposta por estes autores. Das espécies estudadas, oito foram sequenciadas pela primeira vez neste estudo, sendo elas Achlya orion Coker & Couch, A. oviparvula A.L. Rogers & Beneke, Brevilegnia longicaulis T.W. Johnson, Dictyuchus pseudodictyon Coker & Braxton, Leptolegnia eccentrica Coker, Phragmosporangium uniseriatum R.L. Seym., Pythiopsis irregularis R.L. Seym. e Saprolegnia truncata R.L. Seym. As análises filogenéticas realizadas comprovaram que o gênero Leptolegnia pertence à Saprolegniaceae, porém este não é monofilético, com a separação de L. eccentrica de outros representantes do gênero. Por meio deste estudo foi também possível constatar que o gênero Phragmosporangium pertence à Verrucalvaceae, e não mais a Saprolegniaceae, como proposto na descrição original do gênero/espécie. Pela primeira vez espécimes coletados no Brasil são inseridos em análises filogenéticas, o que permitiu a descoberta de uma nova espécie do gênero Saprolegnia para a ciência. Este estudo contribuiu de forma significativa para a taxonomia de Saprolegniales e demonstra a importância da junção dos estudos morfológicos e moleculares.
Palavras-chave: Saprolegniales, ITS e LSU do r DNA, Oomycota, Taxonomia
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