A plataforma de gestão adotada pelo Sistema Ambiental Paulista é formada por 5 diretrizes que representam as principais linhas de atuação da política ambiental do Estado de São Paulo:
- Conservação Ambiental e Restauração Ecológica
- Redução da Pegada Ambiental
- Vulnerabilidade Ambiental e Mudanças Climáticas
- Gestão e Conservação da Fauna Silvestre
- Licenciamento Ambiental
Essas 5 diretrizes estão divididas em 18 programas, monitorados continuamente por meio de indicadores, visando o atingimento das metas de qualidade ambiental.