BIB 5713 \u2013 M\u00c9TODOS ANAL\u00cdTICOS DE SEQU\u00caNCIAS DE DNA PARA ESTUDOS EM DIVERSIDADE<\/p>\n
Profs. Resp.: Drs. Val\u00e9ria Cassano e Carlos Frederico Deluque Gurgel (UFSC)<\/p>\n
Dia da Semana: 2 a 6\u00aa feira<\/p>\n
Hor\u00e1rio: 9 \u00e0s 16h<\/p>\n
Per\u00edodo: 10 a 14\/02\/2020<\/p>\n
Cancelar at\u00e9: 11\/02\/2020<\/p>\n
Cr\u00e9ditos: 2<\/p>\n
Vagas: m\u00e1ximo 25<\/p>\n
Local: Sala 5, Centro Did\u00e1tico \u2013 IB\/USP<\/p>\n
<\/p>\n
OBS.: Os alunos devem trazer seus computadores para as aulas pr\u00e1ticas.<\/p>\n
CONTE\u00daDO: Breve revis\u00e3o dos princ\u00edpios de Sistem\u00e1tica e teoria e principais m\u00e9todos de an\u00e1lise filogen\u00e9tica; pr\u00e9-an\u00e1lise: cross-capillary (e outros tipos) de contamina\u00e7\u00e3o. Algoritmos de alinhamento de DNA, indels, eletroferogramas e contig back-check; concatena\u00e7\u00e3o e an\u00e1lise de parti\u00e7\u00e3o: sele\u00e7\u00e3o de modelos, testes de concatena\u00e7\u00e3o, congru\u00eancia, m\u00e1xima verossimilhan\u00e7a e an\u00e1lise bayesiana de parti\u00e7\u00e3o; ML e Bayesiana: Teste de hip\u00f3teses de topologia, tamanho do conjunto de dados, op\u00e7\u00f5es de software e diferen\u00e7as, web-servidores, burn-in, \u201cdos e dont\u2019s\u201d; bacode de DNA: breve revis\u00e3o dos princ\u00edpios e teoria. Delineamento experimental; m\u00e9todos de c\u00f3digo de barras de DNA: Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD), abordagens de m\u00e1xima verossimilhan\u00e7a e bayesiana para modelos General Mixed Yule Coalescent (GMYC) e Poisson Tree Process approach (PTP); introdu\u00e7\u00e3o \u00e0 an\u00e1lise de informa\u00e7\u00f5es intraespec\u00edfica derivada de dados de sequ\u00eancia de DNA: as diferen\u00e7as entre os processos evolutivos macro e micro, princ\u00edpios em gen\u00e9tica populacional, \u00edndices de diversidade gen\u00e9tica da popula\u00e7\u00e3o e diferencia\u00e7\u00e3o.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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