{"id":5456,"date":"2017-02-13T11:49:16","date_gmt":"2017-02-13T13:49:16","guid":{"rendered":"https:\/\/www.infraestruturameioambiente.sp.gov.br\/pgibt\/?page_id=5456"},"modified":"2018-05-07T11:57:05","modified_gmt":"2018-05-07T14:57:05","slug":"2016-leila-milena-diaz-camacho-dr","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.infraestruturameioambiente.sp.gov.br\/pgibt\/dissertacoesteses\/2016-leila-milena-diaz-camacho-dr\/","title":{"rendered":"Leila Milena Diaz Camacho DR"},"content":{"rendered":"

\"faixapos6\"<\/a><\/h2>\n
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Leila Milena Diaz Camacho<\/strong><\/h2>\n
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Em 17 de junho de 2016, foi realizada a banca de defesa de tese da aluna de doutorado Leila Milena Diaz Camacho do programa de P\u00f3s-Gradua\u00e7\u00e3o em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente do Instituto de Bot\u00e2nica. O trabalho \u00e9 intitulado \u201cDesenvolvimento de marcadores microssat\u00e9lites e caracteriza\u00e7\u00e3o da diversidade gen\u00e9tica de popula\u00e7\u00f5es de Chrysolaena obovata <\/em>(Asteraceae)\u201d. Este trabalho foi orientado pela Dra. Marilia Gaspar (IBt) e co-orientado pela Dra. Maria Angela Machado de Carvalho (IBt).<\/p>\n

A tese foi avaliada pela banca examinadora composta pela Dra. Marilia Gaspar (IBt), Dra. Elizabeth Ann Veasey (ESALQ), Dra. So\u0301nia Cristina da Silva Andrade (USP), Dr. Alessandro Alves Pereira (APTA), Dra. Rita de Ca\u0301ssia Leone Figueiredo-Ribeiro (IBt).<\/p>\n

Chrysolaena obovata<\/em> (Less.) M. Dematteis \u00e9 uma Asteraceae nativa, com ampla distribui\u00e7\u00e3o no Cerrado e que apresenta alto potencial para a produ\u00e7\u00e3o de inulina. Neste trabalho, estudamos a diversidade e estrutura gen\u00e9tica de sete popula\u00e7\u00f5es da esp\u00e9cie de ocorr\u00eancia em \u00e1reas de cerrado sensu stricto<\/em> e campos rupestres, distribu\u00eddas em quatro estados brasileiros. Foram desenvolvidos nove marcadores moleculares do tipo micross\u00e1telites, para os quais foi identificado um alto potencial de transferabilidade em outras esp\u00e9cies de Asteraceae do Cerrado. C. obovata<\/em> apresentou n\u00edveis moderados de diversidade gen\u00e9tica distribu\u00edda majoritariamente dentro das popula\u00e7\u00f5es, com moderada estrutura\u00e7\u00e3o, altos n\u00edveis de fluxo g\u00eanico estimado e uma complexa rede de migra\u00e7\u00e3o entre as popula\u00e7\u00f5es estudadas. Considerando que as popula\u00e7\u00f5es do estado de S\u00e3o Paulo s\u00e3o as que apresentaram menores n\u00edveis de diversidade gen\u00e9tica e se encontram em \u00e1reas com alto grau de perturba\u00e7\u00e3o, estas devem ser consideradas como priorit\u00e1rias em planos de conserva\u00e7\u00e3o ex situ.<\/em><\/p>\n

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Desenvolvimento de marcadores microssat\u00e9lites e caracteriza\u00e7\u00e3o da diversidade gen\u00e9tica de popula\u00e7\u00f5es de Chrysolaena obovata <\/em>(Asteraceae)<\/h3>\n
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ABSTRACT<\/strong><\/h4>\n

Chrysolaena obovata<\/em> (Less.) M. Dematteis (Asteraceae) is an herbaceous, perennial species, native to the Brazilian Cerrado, which presents seasonal growth and underground organs, named rhizophores that accumulate high concentrations of inulin-type fructans. The tolerance of this species to drought, heat and cold, due to fructan accumulation, may explain its wide distribution in the different Cerrado physiognomies. The study of the genetic structure and population dynamics of Cerrado species is crucial to the development of conservation programs for biome. The aim of this study was to develop microsatellite markers to access the genetic diversity and structure of natural populations of C. obovata<\/em> and to analyze fructan content and composition in plants from campos rupestres and cerrado sensu stricto<\/em>. A genomic library enriched with microsatellites was built and forty-two primer pairs were tested, nine of which were shown to be polymorphic. These polymorphic loci were used to determine the genetic diversity and structure of 192 individuals from seven natural populations of C. obovata<\/em>. The cross-amplification rate of these markers ranged from 29.4% to 94.1% in 17 species belonging to seven different tribes of Asteraceae, indicating their potential to be used in future studies of structure and genetic diversity of species from this family. Fifty-two alleles were detected, and the number of alleles per locus ranged from three to nine, with an average of 5.78. The Polymorphic Information Content (PIC<\/em>) ranged from 0.091 to 0.691. The species exhibited moderate genetic diversity (H<\/em> = 0.46). The observed heterozygosity ranged from 0.43 to 0.61. Twenty five rare alleles and 13 private alleles were found. The inbreeding coefficient was negative in all loci (FIS<\/sub><\/em> = -0.220), as well as the overall fixation index (FIT<\/sub><\/em> = -0.113), indicating an excess of heterozygotes, and deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was observed for some loci. The seven analyzed populations showed a moderate differentiation (FST<\/sub><\/em> = 0.087; P <0.001), with higher level of diversity within populations (96.25%, P<\/em><0.001). The hierarchical AMOVA analysis that subdivides the populations according to physiognomy confirmed the greater diversity within populations (96.21%, P<\/em> < 0.01) and the low and non-significant variability among groups (0.09%; P = 0, 41). The SAMOVA analysis divided the populations into five groups, but the percentage of variation was greatest within populations (95.78%; P < 0.05) and negative (-0.80%) among populations within each group. A bottleneck effect was not detected in the populations studied. The gene flow was estimated to be 2.62 migrants per generation. The coalescence analysis showed a complex migratory pattern among populations, showing that the population of Uberl\u00e2ndia is the only that gives migrants to all populations. The Neighbor-joining tree (NJ) grouped the populations into two clusters, but with no significant differences. The Mantel test showed a low but significant correlation among populations genetic and geographic distances (R2<\/sup> = 0.2312, P <\/em>< 0.05), indicating the occurrence of gene flow and weak isolation by distance. Moreover, the results of the Bayesian analysis identified three clustre (K<\/em> = 3), confirming a moderate differentiation of populations. The low population variability is also present in fructan metabolism at the vegetative and flowering stages, which proved to be quite conserved among the four populations studied. The overall results obtained indicate the low genetic differentiation of C. obovata<\/em> populations which can be explained by the reproductive biology (anemocoric dispersion of seeds) and life history of this species (perennial plant widely distributed in the Cerrado).
\nKeywords:<\/strong> Vernonia herbacea<\/em>, microsatellites, Asteraceae, Cerrado, campos rupestres<\/em>, Cross-amplification.<\/p>\n

RESUMO<\/strong><\/h4>\n

Chrysolaena obovata<\/em> (Less.) M. Dematteis (Asteraceae) \u00e9 uma esp\u00e9cie herb\u00e1cea, perene, nativa do Cerrado brasileiro, de crescimento sazonal e que possui \u00f3rg\u00e3os subterr\u00e2neos de reserva, denominados riz\u00f3foros, que acumulam altas concentra\u00e7\u00f5es de frutanos do tipo inulina. Plantas dessa esp\u00e9cie apresentam toler\u00e2ncia \u00e0 seca, ao fogo e ao frio, relacionada ao ac\u00famulo de frutanos, o que pode explicar sua ampla distribui\u00e7\u00e3o nas diferentes fitofisionomias do Cerrado. O estudo da estrutura gen\u00e9tica e da din\u00e2mica das popula\u00e7\u00f5es de esp\u00e9cies do Cerrado \u00e9 fundamental para o desenvolvimento de estrat\u00e9gias de conserva\u00e7\u00e3o deste bioma. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores microssat\u00e9lites para estudar a diversidade e estrutura gen\u00e9tica de popula\u00e7\u00f5es naturais de C. obovata<\/em>, assim como analisar o teor e composi\u00e7\u00e3o dos frutanos em plantas provenientes de campos rupestres e cerrado sensu stricto<\/em>. Foi constru\u00edda uma biblioteca gen\u00f4mica enriquecida com microssat\u00e9lites e foram testados 42 pares de iniciadores, dos quais nove mostraram-se polim\u00f3rficos. Estes loci<\/em> polim\u00f3rficos foram utilizados para a determina\u00e7\u00e3o da diversidade e estrutura gen\u00e9tica de 192 indiv\u00edduos de sete popula\u00e7\u00f5es naturais de C. obovata. <\/em>O potencial de transferabilidade desses marcadores variou de 29,4% a 94,1% em 17 esp\u00e9cies pertencentes a sete tribos distintas da fam\u00edlia Asteraceae, indicando seu potencial para uso em estudos futuros de diversidade gen\u00e9tica de esp\u00e9cies dessa fam\u00edlia. Foram detectados 52 alelos, sendo que o n\u00famero de alelos por locus<\/em> variou de tr\u00eas a nove, com uma m\u00e9dia de 5,78 alelos. O Conteu\u0301do de Informac\u0327a\u0303o Polimo\u0301rfica (PIC<\/em>) variou de 0,091 a 0,691. A esp\u00e9cie apresentou moderada diversidade gen\u00e9tica (H<\/em> = 0,46). A heterozigosidade observada (Ho<\/sub><\/em>) variou de 0,43 a 0,61. Foram encontrados 25 alelos raros e 13 alelos privados. O coeficiente de endogamia apresentou valores negativos em todos os loci<\/em> estudados (FIS<\/sub><\/em> = -0,220), assim como o \u00cdndice de Fixa\u00e7\u00e3o global (FIT<\/sub><\/em> = -0,113), indicando um excesso de heterozigotos e, consequentemente, desvios do equil\u00edbrio de Hardy-Weinberg foram observados em alguns loci<\/em>. As sete popula\u00e7\u00f5es analisadas apresentaram moderada diferencia\u00e7\u00e3o (FST<\/sub><\/em> = 0,087; P<\/em> < 0,001), com maior diversidade dentro das popula\u00e7\u00f5es (96,25%; P <\/em>< 0,001). An\u00e1lise de AMOVA hier\u00e1rquica, que subdivide as popula\u00e7\u00f5es de acordo com a fitofisionomia, confirmou a maior diversidade dentro das popula\u00e7\u00f5es (96,21%;\u00a0P<\/em> < 0,01) sendo que a variabilidade entre os grupos foi baixa e n\u00e3o significativa (0,09%; P<\/em> = 0,41). \u00a0A an\u00e1lise de SAMOVA dividiu as popula\u00e7\u00f5es em cinco grupos, por\u00e9m a porcentagem de varia\u00e7\u00e3o foi maior dentro das popula\u00e7\u00f5es (95,78%; P<\/em> < 0,05) e foi negativa (-0,80%) entre as popula\u00e7\u00f5es dentro de cada grupo. N\u00e3o foi detectado efeito gargalo nas popula\u00e7\u00f5es estudadas. O fluxo g\u00eanico indireto estimado foi de 2,62 migrantes por gera\u00e7\u00e3o. A an\u00e1lise de coalesc\u00eancia mostrou um padr\u00e3o complexo migrat\u00f3rio entre as popula\u00e7\u00f5es, por\u00e9m identificou que a popula\u00e7\u00e3o de Uberl\u00e2ndia \u00e9 a \u00fanica que doa migrantes a todas as popula\u00e7\u00f5es. A \u00e1rvore de Neighbor-joining<\/em> (NJ) agrupou as popula\u00e7\u00f5es em dois clusters<\/em>, mas sem diferencia\u00e7\u00e3o significativa entre eles. O teste de Mantel mostrou uma baixa, por\u00e9m significativa, correla\u00e7\u00e3o entre as dist\u00e2ncias gen\u00e9ticas e geogr\u00e1ficas das popula\u00e7\u00f5es (R2 <\/sup>= 0,2312; P<\/em> < 0,05), indicando que existe fluxo g\u00eanico e baixo isolamento por dist\u00e2ncia. An\u00e1lises Bayesianas identificaram tr\u00eas agrupamentos (K <\/em>= 3), confirmando a moderada diferencia\u00e7\u00e3o das popula\u00e7\u00f5es. Esta baixa variabilidade entre popula\u00e7\u00f5es se reflete tamb\u00e9m no metabolismo de frutanos nas fases vegetativa e de flora\u00e7\u00e3o, que se mostrou bastante conservado entre as quatro popula\u00e7\u00f5es avaliadas. O conjunto dos resultados obtidos indica a baixa diferencia\u00e7\u00e3o gen\u00e9tica das popula\u00e7\u00f5es de C. obovata<\/em>, a qual pode ser explicada por sua biologia reprodutiva (sementes dispersas pelo vento) e sua hist\u00f3ria de vida (planta perene com ampla distribui\u00e7\u00e3o no Bioma Cerrado).
\nPalavras-chave:<\/strong> Vernonia herbacea<\/em>, Micross\u00e1telites, Asteraceae, Cerrado, campos rupestres, Transferabilidade<\/p>\n

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\"pdf_grande\"<\/a>Leila Milena Diaz Camacho<\/a>
\nDesenvolvimento de marcadores microssat\u00e9lites e caracteriza\u00e7\u00e3o da diversidade gen\u00e9tica de popula\u00e7\u00f5es de Chrysolaena obovata <\/em>(Asteraceae)<\/a><\/p>\n

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VOLTAR AS DISSERTA\u00c7\u00d5ES E TESES<\/a><\/strong><\/p>\n

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