Com ênfase na pesquisa científica nas áreas de geociências e meio ambiente, o Instituto Geológico (IG) contribui com a geração de conhecimentos do meio físico voltados à gestão ambiental do território paulista, subsidiando a definição de políticas públicas da Secretaria do Meio Ambiente (SMA) e do governo do Estado.

Atualmente a Instituição mantém 39 projetos de pesquisa científica em geociências e meio ambiente. Os projetos estão distribuídos pelas seguintes áreas de atuação do Instituto: 12 geologia geral, 5 recursos hídricos subterrâneos, 5 geomorfologia, 3 recursos minerais, 4 geotécnica e meio ambiente, 4 climatologia e paleoclima, 2 paleontologia, 2 acervo histórico, 1 geoprocessamento e 1 monumentos geológicos.

As pesquisas contam com o apoio financeiro e logístico do próprio IG e ainda com o auxílio de entidades de fomento à pesquisa científica, nacionais e estaduais, como: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), Fundo Estadual de Recursos Hídricos do Estado de São Paulo (FEHIDRO), Coordenadoria Estadual de Defesa Civil (CEDEC) e Projeto Ambiental Estratégico Aquíferos (PAE).

A pesquisa científica realizada pelo IG é uma importante ferramenta de suporte e apoio na definição de políticas públicas estaduais, levando contribuições para diversos instrumentos, tais como: definição da política ambiental, planejamento e gerência ambiental, zoneamentos ecológicos-econômicos, planos diretores, planos de manejo de unidades de conservação, planos de bacias hidrográficas, licenciamentos ambientais, instrumentos de avaliação de impactos ambientais, regulamentações, legislação, laudos e pareceres.