O Instituto Geológico foi escolhido para ser um dos representantes do Estado nos comitês de bacias do Litoral Norte e do Rio Pardo. Essa participação resulta do reconhecimento por parte desses colegiados da importância da atuação do IG nessas regiões, quer seja no desenvolvimento de projetos, quer seja no apoio direto aos comitês em câmaras técnicas.

Além da participação nas plenárias dos referidos comitês, o IG participará ainda das seguintes câmaras técnicas: Planejamento e Assuntos Institucionais (CT-PAI) e Saneamento (CT-SAN), no caso do comitê do Litoral Norte, e Saneamento e Aguas Subterrâneas, (CT-SAN/AS), no caso do comitê do Rio Pardo.