No Instituto de Botânica você pode aprender um pouco mais desse bioma que é considerado o segundo maior da América do Sul e abrange cerca de 22% do território nacional, além de ser muito representativo do estado de São Paulo. Possui a vegetação bastante diversificada representando cerca de 5% da flora e fauna mundial e 1/3 da biodiversidade brasileira. Porém, tem sofrido intensa degradação e é considerado um dos 35 biomas ricos em biodiversidade e extremamente ameaçados do mundo.

O Instituto de Botânica (IBt) possui ações de pesquisa para conservação da flora do Cerrado, com desenvolvimento de estudos para as espécies ameaçadas. Em 2010, o Instituto organizou o 1º Encontro de Pesquisa sobre Cerrado e Formações Florestais Associadas no Estado de São Paulo, como um estímulo às pesquisas científicas visando a conservação e à recuperação adequada dos cerrados, no território paulista.

Nas estufas históricas do Jardim Botânico de São Paulo pode ser encontrada a Exposição Permanente Cerrado Vivo. A exposição é composta por elementos interativos sobre os principais pontos do cerrado (fisionomias, clima, localização, fauna, flora, etc.), de forma que o visitante do Jardim Botânico, das mais diferentes faixas etárias e dos mais diferentes níveis de escolaridade, possa aprender sobre o bioma de maneira lúdica e interativa. Além desta vertente interativa, a exposição também é composta por elementos naturais, basicamente vegetais de diferentes estratos, representativos do cerrado, oriundos principalmente da Reserva Biológica e Estação Experimental de Mogi-Guaçu, uma Unidade de Conservação administrada pelo IBt.